注释

doi：10.18129/b9.bioc.annotationforge

构建基于SQLITE的注释数据包的工具

生物导体版本：版本（3.15）

提供用于生成注释软件包及其数据库的代码。生产的包装旨在与AnnotationDBI一起使用。

作者：马克·卡尔森（Marc Carlson），赫维·帕格斯（HervéPagès）

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ AnnotationForge”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ AnnotationForge”）

PDF	R脚本	注释：为自定义注释资源创建选择接口
PDF	R脚本	创建探针软件包
html	R脚本	制作新生物包
PDF	R脚本	SQLFORGE：使用标准数据库架构创建新的注释软件包的一种简单方法。
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.38.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（10年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5.0），方法，utils，生物基因（> = 0.15.10），生物酶（> = 1.17.0），AnnotationDbi（> = 1.33.14）
进口	DBI，，，，rsqlite，，，，XML，，，，S4VECTORS，，，，rcurl
链接
建议	Biomart，，，，httr，，，，GenomeInfodB（> = 1.17.1），生物弦，，，，副词，，，，HGU95AV2.DB，，，，Human.DB0，，，，org.hs.eg.db，，，，同性恋，，，，go.db，，，，降价，，，，生物使用，，，，尼特，，，，生物管理器，，，，Biocfilecache
系统要求
增强
URL	//www.andersvercelli.com/packages/annotationforge
BugReports	https://github.com/bioconductor/annotationforge/issues
取决于我
进口我	AnnotationHubdata，，，，gghhumanmethcancerpanelv1.db，，，，gostats，，，，Viseago
建议我	AnnotationDbi，，，，AnnotationHub
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	AnnotationForge_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	AnnotationForge_1.38.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	AnnotationForge_1.38.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotationforge
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/注释
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/annotationforge/
软件包下载报告	下载统计