此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见HTSFilter.
Bioconductor版本:3.14
该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序,以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。
作者:Andrea Rau [cre, aut]
,梅丽娜·加洛平[ctb],吉勒斯·塞吕[ctb],弗洛伦斯Jaffrézic [ctb]
维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>
引文(从R内,输入引用(“HTSFilter”)):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HTSFilter”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | HTSFilter |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件 |
| 版本 | 1.34.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(9年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0) |
| 进口 | 刨边机,DESeq2,BiocParallel,Biobase, utils,统计,grDevices,图形,方法 |
| 链接 | |
| 建议 | EDASeq,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | coseq |
| 建议我 | HTSCluster |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | HTSFilter_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HTSFilter_1.34.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | HTSFilter_1.34.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTSFilter |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HTSFilter/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
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