此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见BPRMeth。
Bioconductor版本:3.14
BPRMeth包是一种量化甲基化谱显式特征的概率方法,在某种程度上可以更容易地在下游建模工作中正式使用这些谱,例如预测基因表达水平或根据甲基化谱聚类基因组区域或细胞。
作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [aut, cre]
维护者:Chantriolnt-Andreas Kapourani
引文(从R内,输入引用(“BPRMeth”)):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BPRMeth”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | BPRMeth:模拟高阶甲基化剖面 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
| biocViews | 贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,ImmunoOncology,KEGG,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0),GenomicRanges |
| 进口 | 为了、方法、质量,doParallel平行,e1071,地球,foreach,randomForest统计数据,IRanges,S4Vectors,data.table、图形、truncnorm,mvtnorm,Rcpp(> = 0.12.14),matrixcalc,magrittr,kernlab,ggplot2,cowplot,BiocStyle |
| 链接 | Rcpp,RcppArmadillo |
| 建议 | testthat,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | 梅丽莎 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | BPRMeth_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BPRMeth_1.20.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | BPRMeth_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BPRMeth |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BPRMeth/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
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