遐

DOI:10.18129 / B9.bioc.MOFA

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这个包适用于Bioconductor的3.12版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见遐(见替换MOFA2)。

多组因子分析(MOFA)

Bioconductor版本:3.12

多组学因素分析:多组学数据集集成的无监督框架。

作者:richard Argelaguet, Britta Velten, Damien Arnol, Florian Buettner, Wolfgang Huber, Oliver Stegle

维护者:Britta Velten < Britta。Velten在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MOFA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“遐”)

超文本标记语言	R脚本	外交部简介
超文本标记语言	R脚本	MOFA:单细胞多组学数据集的应用
超文本标记语言	R脚本	MOFA: CLL患者多组学数据集的应用
超文本标记语言	R脚本	财政部:如何评估模型的稳健性并进行模型选择
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，DimensionReduction，软件，可视化
版本	1.6.2
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	LGPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 3.5)
进口	rhdf5，dplyr，reshape2，pheatmap，corrplot，ggplot2，ggbeeswarm、方法、尺度，GGally，RColorBrewer，cowplot，ggrepel，MultiAssayExperiment，Biobase，doParallel，foreach，网状， grDevices, stats, utils
链接
建议	knitr，MOFAdata
SystemRequirements	Python (>=2.7.0)， numpy, pandas, h5py, scipy, sklearn, mofapy
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MOFA_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	MOFA_1.6.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MOFA_1.6.2.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MOFA
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/MOFA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MOFA/
软件包下载报告	下载数据