mitoODE

DOI:10.18129 / B9.bioc.mitoODE

这个包是弃用．它可能会被从生物导体中移除。请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor中移除。有关最后一个稳定的、最新的发布版本，请参见mitoODE．

“全基因组RNAi活细胞成像分析中表型的动态建模”中描述的微分方程模型的实现

Bioconductor版本:3.11

该包包含了在细胞计数数据上拟合细胞周期模型的方法和再现我们的论文“全基因组RNAi活细胞成像分析中表型的动态模型”中显示的结果的代码，该论文由Pau, G.， Walter, T.， Neumann, B.， Heriche, j.k。(2)、张建平，杨建平，杨建平，杨建平。生物信息学[m] .北京:科学出版社，2013。doi: 10.1186 / 1471-2105-14-308

作者:格雷戈勒加索尔

维护者:Gregoire Pau < Pau。格雷戈勒在gene.com >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mitoODE")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mitoODE”)

PDF	R脚本	mitoODE
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ExperimentData，ImmunoOncology，预处理，软件，TimeCourse
版本	1.26.1
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.14.0),minpack.lm，质量平行,mitoODEdata，KernSmooth
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	mitoODE_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	mitoODE_1.26.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	mitoODE_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mitoODE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mitoODE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mitoODE/
包下载报告	下载数据