基因组数据分析与R / Biocominuctor的趋势

波士顿，美国

2014-07-15〜2014-07-15

教师

• 纽约城市大学Levi Waldron，猎人学院
• Martin Morgan，Fred Hutchinson癌症研究中心
• 文森特凯莉，哈佛大学医学院
• Mike Love，Dana-Farber癌症研究所

描述

生物导体项目是生物信息学的领先发展和分析环境，由专门的程序员核心和广泛的贡献科学界支持。该项目正在快速发展以及测序技术和可用基因组注释的数量，而本研讨会为ISMB与会者提供了在最近和即将到来的生物体趋势的内径。研讨会将从各种学科的领先生物导体包和能力的高级之旅开始，然后将涵盖1）访问基因组注释数据，例如编码和UCSC基因组浏览器，通过AnnotationHub架构，2）数据和算法元素设计用于大型基因组数据的综合分析和允许在运行时可扩展资源利用的注释，以及3）RNA-SEQ数据的分析。研讨会设有项目领导者Martin Morgan，联合创始人和核心会员Vince Carey，咨询委员会成员Levi Waldron，以及博士博士的迈克尔爱（Rafael Irizarry Lab）。该研讨会适用于广泛的受众，并对初学者对基因组数据的分析师有价值。

材料

概述 - Levi Waldron

• PDF.幻灯片演示文稿

访问注释资源 - Martin Morgan

• PDF.幻灯片演示文稿
• R.基本工作流程：从符号到基因模型和序列
• R.AnnotationHub工作流程：在CHR17附近的基因附近的进化保守增强子SNP

可扩展的综合生物信息学与生物导体 - 文森特凯悦

• PPT.幻灯片演示文稿

RNA-SEQ数据分析 - Mike Love

• HTML.