weitrix

DOI:10.18129 / B9.bioc.weitrix

用于具有精确权重的矩阵的工具，测试和探索加权或稀疏数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

用于处理具有精确权重和缺失数据的矩阵的数据类型和工具。此包提供了可用于多种类型的高吞吐量数据的通用表示和工具。权重的含义与基本R函数“lm”和包“limma”中的用法兼容。校准权重以考虑已知的精度预测因素。找到具有过度可变性的行。执行差异测试并找到置信差异最大的行。即使有许多缺失值，也要找到类似于pca的变异分量，旋转以使单个分量得到有意义的解释。支持DelayedArray矩阵和BiocParallel。

作者:Paul Harrison [aut, cre]

维护者:Paul Harrison < Paul。Harrison, monash。edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“weitrix”)

超文本标记语言		1.概念和实践细节
超文本标记语言	R脚本	2.poly(A)尾巴长度的例子
超文本标记语言	R脚本	3.可变聚腺苷酸化
超文本标记语言	R脚本	4.RNA-Seq表达示例
超文本标记语言	R脚本	5.比例数据的例子与SLAM-Seq
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation，DimensionReduction，GeneExpression，RNASeq，回归，SingleCell，软件，转录组
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	LGPL-2.1 |文件许可证
取决于	R (>= 3.6)，SummarizedExperiment
进口	方法，utils, stats, grDevices，为了，S4Vectors，DelayedArray，DelayedMatrixStats，BiocParallel，BiocGenerics，limma，topconfects，dplyr，purrr，ggplot2，rlang，尺度，reshape2样条函数,Ckmeans.1d.dp，glm2，RhpcBLASctl
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，tidyverse，气道，刨边机，EnsDb.Hsapiens.v86，org.Sc.sgd.db，AnnotationDbi，ComplexHeatmap，拼接而成，testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	weitrix_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	weitrix_1.10.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	weitrix_1.10.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	weitrix_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/weitrix
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/weitrix
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/weitrix/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/weitrix/
软件包下载报告	下载数据