石棉水泥板

DOI:10.18129 / B9.bioc.transite

rna结合蛋白的主题分析

Bioconductor版本:版本(3.16)

石棉水泥板是一种计算方法,允许监管作用的综合分析rna结合蛋白在各种细胞过程利用先前存在的基因表达数据和当前绑定偏好的rna结合蛋白的知识。

作者:康斯坦丁Krismer (cre aut, cph],安娜Gattinger (aut),迈克尔Yaffe[解说,cph],伊恩Cannell(黑色)

维护人员:康斯坦丁Krismer < Krismer mit.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“石棉水泥板”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“石棉水泥板”)

HTML	R脚本	光谱主题分析(SPMA)
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,微阵列,软件,转录,mRNAMicroarray
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5)
进口	BiocGenerics(> = 0.26.0),Biostrings(> = 2.48.0),dplyr(> = 0.7.6),GenomicRanges(> = 1.32.6),ggplot2(> = 3.0.0),ggseqlogogrDevices (> = 0.1),gridExtra(> = 2.3),方法,平行,Rcpp(> = 1.0.4.8),尺度(> = 1.0.0),统计数据,TFMPvalue(> = 0.0.8),跑龙套
链接	Rcpp(> = 1.0.4.8)
建议	knitr(> = 1.20),rmarkdown(> = 1.10),roxygen2(> = 6.1.0),testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://transite.mit.edu
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	transite_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	transite_1.16.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	transite_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	transite_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/石棉水泥板
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/transite/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/transite/
包下载报告	下载数据