鞑靼

DOI:10.18129 / B9.bioc.tartare

记录在原始地面光谱热费希尔科学质谱仪

Bioconductor版本:版本(3.16)

提供原始文件记录在不同液相色谱质谱分析(质)工具。所有包括医学仪器是由热费希尔科学和制造属于Orbitrap Tribrid或者Q Exactive Orbitrap家族的工具。尽管他们共同起源和硬件组件,例如。,Orbitrap mass analyser, the above instruments tend to write data in different "dialects" in a shared binary file format (.raw). The intention behind tartare is to provide complex but slim real-world files that can be used to make code robust with respect to this diversity. In other words, it is intended for enhanced unit testing. The package is considered to be used with the rawrr package and the Spectra MsBackends.

作者:基督教Panse (aut (cre),托拜厄斯Kockmann (aut)

维护人员:基督教Panse < cp在fgcz.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“鞑靼”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“鞑靼”)

HTML	R脚本	鞑靼制作和使用数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,MassSpectrometryData
版本	1.12.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1),AnnotationHub(> = 2.16),ExperimentHub(> = 1.0)
进口	跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat、工具
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cpanse/tartare
BugReports	https://github.com/cpanse/tartare/issues
取决于我
进口我
建议我	MsBackendRawFileReader,rawrr
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	tartare_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tartare
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/鞑靼
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/tartare/
包下载报告	下载数据