Bioconductor版本:发行版(3.16)
synapter包提供了重新分析Synapt G2质谱仪上获得的无标签蛋白质组学数据的功能。一次或几次运行,可能与额外的离子迁移分离处理,以提高识别精度,可以结合到其他定量文件,以最大限度地提高识别和定量精度。
作者:Laurent Gatto, Nick J. Bond, Pavel V. Shliaha和Sebastian Gibb。
维护者:Laurent Gatto < Laurent。在uclouvain的Gatto。be> Sebastian Gibb
引文(从R内,输入引用(“synapter”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“synapter”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用“突触”结合HDMSe/MSe数据以优化识别和定量 |
超文本标记语言 | R脚本 | 使用“突触”进行片段匹配 |
超文本标记语言 | R脚本 | Synapter2和synergise2 |
参考手册 |
biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 2.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(10.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 3.1.0),方法,MSnbase(> = 2.1.2) |
进口 | RColorBrewer,晶格,qvalue,乘, utils,工具,Biobase,Biostrings,切肉刀(> = 1.3.3),readr(> = 0.2),rmarkdown(> = 1.0) |
链接 | |
建议 | synapterdata(> = 1.13.2),xtable,testthat(> = 0.8),大脑,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://lgatto.github.io/synapter/ |
全靠我 | synapterdata |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | synapter_2.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | synapter_2.22.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | synapter_2.22.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | synapter_2.22.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synapter |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/synapter |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/synapter/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/synapter/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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