sevenbridges

DOI:10.18129 / B9.bioc.sevenbridges

七桥平台API客户端和R通用工作流语言工具构建器

Bioconductor版本:发行版(3.16)

R客户端和七桥平台API的实用程序，从癌症基因组云到其他七桥支持的平台。

作者:Soner Koc [aut, cre]，肖楠[aut]，尹腾飞[aut]， Dusan Randjelovic [ctb]， Emile Young [ctb]， Seven Bridges Genomics [cph, fnd]

维护者:Soner Koc < Soner。Koc在sevenbridges.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“sevenbridges”)

超文本标记语言	R脚本	七桥API R客户端的完整指南
超文本标记语言	R脚本	创建Docker容器和命令行接口(使用docopt)
超文本标记语言	R脚本	在R中描述和执行CWL工具/工作流
超文本标记语言	R脚本	通过数据浏览器和数据集API在CGC上查找数据
超文本标记语言	R脚本	IDE容器:RStudio服务器，Shiny服务器等
超文本标记语言	R脚本	大师教程:使用R for癌症基因组云
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,软件,ThirdPartyClient
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	Apache License 2.0 |文件许可证
取决于	方法，utils，统计
进口	httr,jsonlite,yaml,objectProperties,stringr,S4Vectors,docopt,旋度,uuid,data.table
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,readr
SystemRequirements
增强了
URL	https://www.sevenbridges.comhttps://sbg.github.io/sevenbridges-r/https://github.com/sbg/sevenbridges-r
BugReports	https://github.com/sbg/sevenbridges-r/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	sevenbridges_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	sevenbridges_1.28.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	sevenbridges_1.28.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	sevenbridges_1.28.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sevenbridges
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sevenbridges
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/sevenbridges/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/sevenbridges/
软件包下载报告	下载数据