rfaRm

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfaRm

R Rfam数据库接口

Bioconductor版本:版本(3.16)

rfaRm Rfam数据库提供了一个客户端接口的RNA的家庭。可以检索数据,包括RNA家庭,二级结构图像,协方差模型、序列在每个家庭中,排列导致一个家庭的识别和二级结构的dot-bracket格式。

作者:劳拉出售比达尔,拉斐尔•阿亚拉Guy-Bart斯坦,罗德里戈Ledesma-Amaro

维修工:劳拉出售比达尔<劳拉。销售在oist.jp >,拉斐尔Ayala <拉斐尔。阿亚拉在oist.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rfaRm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rfaRm”)

HTML	R脚本	rfaRm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,FunctionalGenomics,MultipleSequenceAlignment,软件,ThirdPartyClient,可视化
版本	1.10.2
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	httr,stringi,rsvg,魔法,data.table,Biostrings跑龙套,房车,xml2,IRanges,S4Vectors
链接
建议	R4RNA,treeio,knitr,BiocStyle,rmarkdown,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	rfaRm_1.10.2.tar.gz
Windows二进制	rfaRm_1.10.2.zip
macOS二进制(x86_64)	rfaRm_1.10.2.tgz
macOS二进制(arm64)	rfaRm_1.10.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfaRm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rfaRm
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rfaRm/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rfaRm/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档