变体

DOI:10.18129 / B9.bioc.variants

注释的基因变异

生物导体版本:发布(3.12)

读写VCF文件。识别变异的结构位置并计算非同义变异的氨基酸编码变化。利用SIFT和PolyPhen数据库包预测氨基酸编码变化的结果

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

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如果(!安装BiocManager::install(" versions ")

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文档

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browseVignettes(“变异”)

超文本标记语言

R脚本

注释的基因变异

细节

biocViews	AnnotationWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流
版本	1.13.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),VariantAnnotation,cgdv17,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/variants/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	variants_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variants
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/变体
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/variants/
包下载报告	下载数据