SimpleSingleCell.

DOI：10.18129 / b9.bioc.simplesinglecell.

具有Biocumonductor的单单元RNA-SEQ数据的低级分析的逐步工作流程

Biocometiond版本：释放（3.12）

一旦骄傲的工作流程包，这现在就是其前自我的壳牌。它几乎所有内容都被蚕食，以便在HTTPS://OSOMA.BIOCOCTIONDER.ORG处于“使用BIOCORADIONS的协调单细胞分析”书中。这里的大多数鸽子都被保留为荣耀的提醒，也曾经为相关的OSCA书章节提供了现有的外部链接重定向。

作者：Aaron LUN [AUT，CRE]，Davis McCarthy [Aut]，John Marioni [Aut]

维护者：Aaron LUN

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“simplesinglecell”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“SIMPLESSINGLECELL”）

HTML.		01.介绍
HTML.		02.读取计数数据
HTML.		03. UMI计数数据
HTML.		04.基于液滴的数据
HTML.		05.校正批处理效果
HTML.		06.质量控制细节
HTML.		07.尖峰标准化
HTML.		08.检测双峰
HTML.		09.高级方差建模
HTML.		10.检测差异表达
HTML.		11.高级批量校正
HTML.		12.大数据的可扩展性
HTML.	r script.	13.进一步的分析策略

细节

Biocviews.	免疫系统工作流程那singlecellworkflow.那工作流程
版本	1.14.0
执照	艺术-2.0
依靠
进口	Utils，方法，kn那Callr.那RAMAMAMDOW.那CodeDepends.那生物焦
链接到
建议	readxl.那R.utils.那SinglecellexPeriment.那撒尿那斯那林马那biocfilecache.那org.mm.eg.db.
系统要求
加强
URL.	https://www.biocumon.org/help/workflows/simplesinglecell//
取决于我
进口我
建议我
链接给我

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	simplesinglecell_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocondator.org/packages/simplesinglecell.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包/ simplesinglecell
包短网址	https://biocumon.org/packages/simplesinglecell/
包裹下载报告	下载统计信息