EGSEA123

DOI:10.18129 / B9.bioc.EGSEA123

简易高效的EGSEA集成基因集测试

Bioconductor版本:发布(3.12)

Alhamdoosh et al.(2017)，支持f1000研究工作流程文章“Easy and efficient ensemble gene set testing with EGSEA”的R包。

作者:mother Alhamdoosh, Charity Law, Luyi Tian, Julie Sheridan, Milica Ng和Matthew Ritchie

维护人员:Matthew Ritchie

安装

要安装这个包，启动R(版本为“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EGSEA123")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档，启动R并输入:

browseVignettes(“EGSEA123”)

超文本标记语言

R脚本

简易高效的EGSEA集成基因集测试

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流
版本	1.13.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4.0),EGSEA(> = 1.5.2),limma,刨边机,illuminaio
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循安装在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	EGSEA123_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EGSEA123
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EGSEA123
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/EGSEA123/
包下载报告	下载数据