跨石

doi：10.18129/b9.bioc.transite

RNA结合蛋白基序分析

生物导体版本：版本（3.15）

Transite是一种计算方法，可以通过利用先前存在的基因表达数据和RNA结合蛋白结合偏好的当前知识来全面分析RNA结合蛋白在各种细胞过程中的调节作用。

作者：Konstantin Krismer [AUT，CRE，CPH]，Anna Gattinger [aut]，迈克尔·耶夫[THS，CPH]，伊恩·坎内尔[THS]

维护者：MIT.edu的Konstantin Krismer

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ transite”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ transite”）

html	R脚本	频谱基序分析（SPMA）
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.5）
进口	生物基因（> = 0.26.0），生物弦（> = 2.48.0），dplyr（> = 0.7.6），基因组机（> = 1.32.6），GGPLOT2（> = 3.0.0），ggseqlogo（> = 0.1），grdevices，栅格（> = 2.3），方法，并行，RCPP（> = 1.0.4.8），秤（> = 1.0.0），统计，TFMPVALUE（> = 0.0.8），UTILS
链接	RCPP（> = 1.0.4.8）
建议	尼特（> = 1.20），rmarkDown（> = 1.10），roxygen2（> = 6.1.0），测试（> = 2.1.0）
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://transite.mit.edu
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	transite_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	transite_1.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	transite_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/跨矿石
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/transite/
软件包下载报告	下载统计