散粒

DOI:10.18129 / B9.bioc.scHOT

单细胞高阶测试

生物导体版本:发布(3.13)

单细胞高阶检测(scHOT)是一个R包，有助于检测基因表达的高阶结构沿发育轨迹或跨空间的变化。scHOT本质上是通用的和模块化的，可以在多个数据上下文中运行，比如沿着连续的轨迹运行，在离散的组之间运行，在空间方向上运行;以及适应任何更高的顺序测量，如可变性或相关性。scHOT有意义地增加了一阶效应测试，如差分表达式，并提供了一个从单细胞数据询问高阶交互作用的框架。

作者:Shila Ghazanfar [aut, cre]， Yingxin Lin [aut]

维护者:Shila Ghazanfar

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("scHOT")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(散粒)

超文本标记语言	R脚本	开始:散粒
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	S4Vectors(> = 0.24.3),SingleCellExperiment,矩阵,SummarizedExperiment,IRanges、方法、统计数据BiocParallel,重塑,ggplot2,igraphgrDevices,ggforce、图形
链接
建议	knitr,rmarkdown,嘘,scattermore,尺度,matrixStats,deldir
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	scHOT_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	scHOT_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scHOT_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scHOT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/散粒
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scHOT/
包下载报告	下载数据