ropls

doi：10.18129/b9.bioc.ropls

PCA，PLS（-DA）和OPLS（-DA）用于多变量分析和特征OMICS数据的特征选择

生物导体版本：版本（3.15）

带有主组件分析（PCA）和部分最小二乘（PLS）的潜在变量建模是可视化，回归，分类和特征选择的强大方法，其中变量数量超过样本数量，并且变量之间具有多重共线性。正交局部最小二乘（OPL）使变化（预测）与感兴趣因素和不相关（正交）变化的变异相关（预测）。在与PLS相似的同时，OPLS促进了解释。这些化学计量学技术的成功应用包括光谱数据，例如拉曼光谱，核磁共振（NMR），质谱法（MS）在代谢组学和蛋白质组学中，以及转录组学数据。除了得分，负载和权重图外，该软件包还提供指标和图形，以确定最佳组件数量（例如，使用R2和Q2系数），通过置换测试，检测异常值和执行特征选择，检查模型的有效性（例如，在投影或回归系数中具有可变的重要性）。可以通过workflow4metabolomics.org在线资源（基于银河系环境）上的在线资源上的用户界面访问该软件包。

作者：Etienne A. Thevenot

维护者：etienne A. thevenot

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ ROPLS”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ropls”）

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文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.28.0
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（6。5年）
执照	塞西尔
要看	生物酶
进口	图形，grdevices，方法，多胎，统计
链接
建议	生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，多检验，，，，Omicade4，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL	http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00354
取决于我	生物签名
进口我	ASIC，，，，lipidr，，，，Multibac，，，，profia，，，，RQT
建议我	自治，，，，ptairms，，，，structToolbox
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ropls_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	ropls_1.28.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ropls_1.28.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ropls
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ropls
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ropls/
软件包下载报告	下载统计