prebs

DOI:10.18129 / B9.bioc.prebs

RNA-seq数据的探针区域表达估计，以提高微阵列的可比性

Bioconductor版本:发行版(3.13)

prebs包旨在使rna -测序(RNA-seq)数据与微阵列数据更具可比性。利用改进的RMA算法对基于序列的探测区域表达式进行总结，从而实现了相似性。该管道将BAM格式的映射读取作为输入，并生成基因表达式或原始微阵列探测集表达式作为输出。

作者:Karolis Uziela和Antti Honkela

维护者:Karolis Uziela < Karolis。在scilifelab.se uziela >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("prebs")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“prebs”)

PDF	R脚本	prebs用户指南
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.14.0),GenomicAlignments，affy，战
进口	平行,方法、统计数据GenomicRanges(> = 1.13.3),IRanges，Biobase，GenomeInfoDb，S4Vectors
链接
建议	prebsdata，hgu133plus2cdf，hgu133plus2probe
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	prebs_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	prebs_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	prebs_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/prebs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ prebs
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/prebs/
包下载报告	下载数据