MetagenomeSQ.

DOI：10.18129 / b9.bioc.metagenomeseq.

稀疏高通量测序的统计分析

Biocometiond版本：释放（3.12）

MetagenomeSeq旨在确定特征（例如它是运营罗洲单位（OTU），物种等），其在两组或更多种多个样本中差异丰富。MetagenomeSeq旨在解决微生物社区对疾病关联检测和特征相关性的测试的归一化和脱模的影响。

作者：Joseph Nathaniel Paulson，Nathan D. Olson，Domenick J. Braccia，Justin Wagner，Hisham Talukder，Mihai Pop，Hector Corrada Bravo

维护者：Joseph N.Paulson

安装

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if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“metagenomeseq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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BROWSEVIGNETTES（“METAGENOMESEQ”）

PDF.	r script.	Fittimeeries：通过时间或位置进行差异丰富分析
PDF.	r script.	MetagenomeSQ：稀疏高通量测序的统计分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（8年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.0），BioBase.那林马那glmnet.， 方法，rcolorbrewer.
进口	平行，MatrixStats.那Foreach.那矩阵那贡献，图形，grdevices，stats，utils，扳手
链接到
建议	注释那生物根系那BiomFormat那kn那GSS.那testthat.（> = 0.8），素食主义者那互动神血那IHW.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/nosson/metagenomeseq/
Bugreports.	https://github.com/nosson/metagenomequesq/issues.
取决于我	ETEC16S.那梅拉维兹尔那microbiomeexplorer.那MSD16S.
进口我	Maaslin2.那microbiomedasim
建议我	腌制胶癌那互动神血那文学那扳手
链接给我
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包档案包

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源包	metagenomeseq_1.32.0.tar.gz.
Windows二进制文件	metagenomeseq_1.32.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	metagenomeseq_1.32.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/metagenomeSeq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ metagenomeSeq
包短网址	https://biocumon.org/packages/metagenomeseq/
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