Epigenomix.

DOI:10.18129 / b9.bioc.epigenomix.

表观遗传和基因转录数据标准化与混合模型集成

Bioconductor版本:释放(3.13)

通过芯片-SEQ获得的RNA-SEQ或基于微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的封装。该包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及拟合贝叶斯混合模型的方法,以便检测两个数据类型差异的基因。

作者:Hans-Ulrich Klein,Martin Schaefer

维护者:Hans-Ulrich Klein

引文(从R内,输入引文(“epigenomix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“epigenomix”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“EPIGENOMIX”)

PDF. r script. Epigenomix包小插图
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.32.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(8年)
执照 LGPL-3
依靠 R(> = 3.2.0),方法,BioBase.S4Vectors.绞喉Genomicranges.概括分析
进口 生物根系McMcpack.RSAMTOOLS., 平行,Genomeinfodb.Beadarray
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 Epigenomix_1.32.0.tar.gz.
Windows二进制文件 epigenomix_1.32.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) EPIGENOMIX_1.32.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/epigenomix.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ epigenomix
包短网址 https://biocumon.org/packages/epigenomix/
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