库务

doi：10.18129/b9.bioc.copynumber

通过惩罚最小二乘回归对单轨和多轨副本编号数据进行分割。

生物导体版本：版本（3.13）

惩罚最小二乘回归用于拟合分段恒定曲线以复制数字数据以定位恒定拷贝数的基因组区域。程序可用于每个样本的单个分割，几个样本的联合分割以及SNP阵列的两个数据轨道的联合分割。有几个绘图功能可用于可视化数据和分割结果。

作者：Gro Nilsen，Knut Liestoel和Ole Christian Lingjaerde。

维护者：gro nilsen

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ cypernumber”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“库务”）

PDF	R脚本	CAPYNUMBER.PDF
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（8年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 2.10），生物基因
进口	S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	序列
建议我	属属
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	coplenumber_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	CAYMNUMBER_1.32.0.ZIP（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	coplenumber_1.32.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/copynumber
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：套餐/唱片
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/copynumber/
软件包下载报告	下载统计