宝石

DOI：10.18129 / b9.bioc.blima.

用于检测器（珠子）水平的Illumina微阵列预处理和分析的工具

Bioconductor版本：释放（3.13）

Package Blima包括用于预处理Illumina微阵列数据的几种算法。它侧重于珠子水平分析，并提供了对不等长度的载体的定量标准化的新方法。它提供了各种背景校正方法，包括背景减法，RMA，如卷积和背景异常删除。它还实现了珠子水平上的方差稳定转换。还有还实现了数据摘要的方法。它还提供了用于对检测器（珠子）水平和探针水平进行T检验的方法进行差异表达测试。

作者：vojtěchkulvait

维护者：vojtěchkulvait

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“blima”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Blima”）

PDF.	r script.	Blima.pdf.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（6.5岁）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 3.3）
进口	Beadarray（> = 2.0.0），BioBase.（> = 2.0.0），rcpp.（> = 0.12.8），生物根系，grdevices，stats，图形
链接到	rcpp.
建议	xtable.那blimatestingdata.那生物焦那illiminahumanv4.db.那lumi.那kn
系统要求
加强
URL.	https://bitbucket.org/kulvait/blima.
取决于我
进口我
建议我	blimatestingdata.
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	blima_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	blima_1.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	blima_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/blima.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ blima
包短网址	https://biocumon.org/packages/blima//
包裹下载报告	下载统计信息