RTCGA.

DOI：10.18129 / b9.bioc.rtcga.

癌症基因组图集数据集成

Bioconductor版本：释放（3.13）

癌症基因组ATLAS（TCGA）数据门户为研究人员提供了搜索，下载和分析TCGA生成的数据集的平台。它包含肿瘤基因组的临床信息，基因组特征数据和高水平序列分析。关键是要了解基因组学改善癌症护理。RTCGA包使用患者条码键提供下载和集成的TCGA数据，可实现更容易的数据占有。这可能对对科学发展的影响和对患者治疗的改善产生生育的作用。此外，RTCGA封装将TCGA数据转换为整洁的形式，这方便使用。

作者：Marcin Kosinski ，Przemyslaw Biecek

维护者：Marcin Kosinski

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！procennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“rtcga”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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BROWSEVIGNETTES（“RTCGA”）

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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.22.0
在生物导体中以来	BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.3.0）
进口	XML.那assertthat.那stringi.那累那data.table.那XML2.那dplyr.那邮风那生存那SURVMINER.那ggplot2.那ggthemes.那viridis.那kn那秤
链接到
建议	devtools.那testthat.那p那BioBase.那Genomicranges.那绞喉那S4Vectors.那RTCGA.rnaseq.那Rtcga.Clinical.那RTCGA.Mutations.那RTCGA.RPPA那RTCGA.MRNA那Rtcga.mirnaseq.那rtcga.methylation.那RTCGA.CNV.那RTCGA.PANCAN12.那Magrittr.那Tidyr.
系统要求
加强
URL.	https://rtcga.github.io/rtcga.
Bugreports.	https://github.com/rtcga/rtcga/issues.
取决于我	Rtcga.Clinical.那RTCGA.CNV.那rtcga.methylation.那Rtcga.mirnaseq.那RTCGA.MRNA那RTCGA.Mutations.那RTCGA.PANCAN12.那RTCGA.rnaseq.那RTCGA.RPPA
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	RTCGA_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	RTCGA_1.22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	RTCGA_1.22.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/rtcga.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ rtcga
包短网址	https://biocumon.org/packages/rtcga/
包裹下载报告	下载统计信息