RSVSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.RSVSim

RSVSim:用于模拟结构变化的R/Bioconductor包

Bioconductor版本:发行版(3.13)

RSVSim是一个包，用于模拟任何基因组中各种大小的删除、插入、倒置、串联复制和易位，可作为fasta文件或BSgenome数据包。SV断点可以均匀地放置在整个基因组中，倾向于重复区域和高同源性区域(对于hg19)或在用户提供的坐标上。

作者:Christoph Bartenhagen

维护者:Christoph Bartenhagen 的Bartenhagen

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RSVSim”)

PDF	R脚本	RSVSim:用于模拟结构变化的R/Bioconductor包
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在Bioconductor公司	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 3.0.0)，Biostrings，GenomicRanges
进口	方法,IRanges，ShortRead
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，质量，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RSVSim_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	RSVSim_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RSVSim_1.32.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RSVSim
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RSVSim
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RSVSim/
软件包下载报告	下载数据