MassArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.MassArray

MassArray数据分析工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包用于导入、质量控制、分析和使用Sequenom的MassArray平台生成的甲基化数据的可视化。这里的工具包含一个非常详细的扩增子预测优化分析设计。还包括数据的质量控制措施，如引物二聚体和亚硫酸氢盐转换效率的估计。甲基化数据计算使用相同的算法包含在EpiTyper软件包。此外，自动snp检测可用于标记来自特定CG站点的潜在混淆数据。可视化包括甲基化数据的条形图以及UCSC基因组浏览器兼容的BED轨迹。多种分析方法可以组合在一起进行综合分析。

作者:里德·f·汤普森<里德。汤普森在gmail.com>，John M. Greally

维护者:Reid F. Thompson < Reid。汤普森在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MassArray”)

PDF	R脚本	1.底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.50.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(13年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.10.0)，方法
进口	图形，grDevices，统计，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MassArray_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	MassArray_1.50.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MassArray_1.50.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MassArray_1.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MassArray
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MassArray
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MassArray/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MassArray/
软件包下载报告	下载数据