htqpcr

doi:10.18129/b9.bioc.htqpcr

高通量QPCR数据的自动分析

生物导体版本:版本(3.15)

分析来自多种条件或重复的高吞吐量实时PCR(QPCR)测定的CT值。输入数据可以来自空间定义的格式,例如Abi Taqman低密度阵列或OpenArray;罗氏应用科学的Lightcycler;来自Bio-Rad实验室的CFX板;常规的96或384孔板;或微流体设备,例如Fluidigm Corporation的动态阵列。HTQPCR处理数据加载,质量评估,归一化,可视化以及参数或非参数测试,以在特征之间的CT值(例如基因,microRNA)之间进行统计显着性。

作者:Heidi Dvinge,Paul Bertone

维护者:fredhutch.org> Heidi dvinge

引用(从r内,输入引用(“ HTQPCR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ htqpcr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ htqpcr”)

PDF R脚本 R中的QPCR分析
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细节

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版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(12。5年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶,,,,rcolorbrewer,,,,林玛
进口 副词,,,,生物酶,,,,GPLOTS,图形,grdevices,林玛, 方法,rcolorbrewer,Stats,Stats4,Utils
链接
建议 Statmod
系统要求
增强
URL http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
取决于我
进口我 无索引,,,,unifiedwmwqpcr
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 htqpcr_1.50.0.0.tar.gz
Windows二进制 htqpcr_1.50.0.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) htqpcr_1.50.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htqpcr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/htqpcr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/htqpcr/
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