DriverNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.DriverNet

Drivernet:揭示体细胞驱动突变调节转录网络在癌症

Bioconductor版本:版本(3.16)

DriverNet是一个包来预测基因功能的重要驱动力在癌症通过整合基因组数据(突变和拷贝数变异数据)和转录组数据(基因表达数据)。不同种类的影响相结合的数据图,这是一种基因基因相互作用网络推断从路径数据。使用贪婪算法来找到可能的驱动基因,更多的患者可能突变,这些突变将推动基因的基因表达值连接一些极端值。

作者:阿里Bashashati Reza Haffari, Jiarui丁,加文·哈,肯尼斯·刘,杰米Rosner和索拉沙

维护人员:Jiarui叮< jiaruid在cs.ubc.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DriverNet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	介绍DriverNet
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(10年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 2.10),方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	DriverNet_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	DriverNet_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64)	DriverNet_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64)	DriverNet_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DriverNet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DriverNet
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DriverNet/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DriverNet/
包下载报告	下载数据