DeMixT

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeMixT

使用来自RNAseq或微阵列平台的表达数据对具有两到三种成分的异构肿瘤样本进行细胞类型特异性反褶积

Bioconductor版本:Release (3.15)

DeMixT是一种软件包,可以对两到三个组分的混合转录组数据进行反褶积。

作者:Zeya Wang ,曹少龙,王文怡

维护者:帅过<帅。郭在uth.tmc.edu>

引文(从R内,输入引用(“DeMixT”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DeMixT”)

超文本标记语言 R脚本 DeMixT。限制型心肌病
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版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 3.6.0),平行,Rcpp(> = 1.0.0),SummarizedExperimentknitrKernSmoothmatrixcalcrmarkdown
进口 matrixStats统计数据,truncdistbase64encggplot2
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 DeMixT_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 DeMixT_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) DeMixT_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeMixT
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DeMixT
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DeMixT/
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