Bioconductor版本:发行版(3.13)
用于ChIP-seq数据分析的统计工具。该软件包包括Kaufmann等人(2009)描述的统计方法。PLoS生物学:7(4):e1000090。简单地说,考虑到测序的平均DNA片段大小,软件计算基因组单核苷酸读-富集值。归一化后,采用基于泊松分布的检验对样本和对照进行比较。通过随机排列获得控制误发现率的检测统计阈值。
作者:Jose M Muino
维护者:Jose M Muino < Jose。Muino, live.com>
引用(从R中,输入引用(CSAR)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CSAR")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (CSAR)
R脚本 | CSAR装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.44.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.6 (R-2.11)(11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.15.0),S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges |
进口 | 统计,跑龙套 |
链接 | |
建议 | ShortRead,Biostrings |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | CSAR_1.44.0.tar.gz |
Windows二进制 | CSAR_1.44.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | CSAR_1.44.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/CSAR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CSAR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CSAR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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