Biseq.

DOI：10.18129 / b9.bioc.biseq.

加工和分析亚硫酸氢盐测序数据

Bioconductor版本：释放（3.13）

BISEQ包提供有用的类和功能来处理和分析有针对性的Biulfite测序（BS）数据，例如衰减率Biulfite测序（RRB）数据。特别地，它实现了一种检测差异甲基化区域（DMRS）的算法。该包已从一个或多个样本中进行了对齐BS数据。

作者：katja hebestreit，Hans-Ulrich Klein

维护者：Katja hebestreit

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“biseq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“BISEQ”）

PDF.	r script.	Biseq介绍
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（8年）
执照	LGPL-3
依靠	R（> = 2.15.2），方法，S4Vectors.那绞喉（> = 1.17.24），Genomicranges.那概括分析（> = 0.2.0），公式
进口	方法，生物根系那BioBase.那S4Vectors.那绞喉那genomeinfodb.那Genomicranges.那概括分析那rtracklayer.， 平行，Betareg.那Lokern.那公式那全球化境
链接到
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系统要求
加强
URL.
取决于我	rrbsdata.
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	biseq_1.32.0.tar.gz.
Windows二进制文件	biseq_1.32.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	biseq_1.32.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/biseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ Biseq
包短网址	https://biocumon.org/packages/biseq/
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