qPLEXanalyzer

DOI:10.18129 / B9.bioc.qPLEXanalyzer

定量蛋白质组学数据分析的工具

Bioconductor版本:版本(3.16)

基于TMT的定量蛋白质组学数据分析的工具。

作者:马修•埃尔德里奇(aut),卡基肖尔(aut),阿什利·本纪念册(aut (cre)

维护人员:希礼本纪念册< ads2202cu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qPLEXanalyzer”)

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文档

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HTML	R脚本	qPLEXanalyzer
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,ImmunoOncology,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0),Biobase,MSnbase
进口	为了,BiocGenerics,Biostrings,dplyr(> = 1.0.0),ggdendro,ggplot2、图形、grDevicesIRanges,limma,magrittr,preprocessCore,purrr,RColorBrewer,readr,rlang,尺度统计数据,stringr,宠物猫,tidyr,tidyselect,跑龙套
链接
建议	gridExtra,knitr,qPLEXdata,rmarkdown,testthat,UniProt.ws,vdiffr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/crukci-bioinformatics/qPLEXanalyzer/issues
取决于我	qPLEXdata
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	qPLEXanalyzer_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	qPLEXanalyzer_1.16.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	qPLEXanalyzer_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	qPLEXanalyzer_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qPLEXanalyzer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qPLEXanalyzer
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/qPLEXanalyzer/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qPLEXanalyzer/
包下载报告	下载数据