后代

DOI:10.18129 / B9.bioc.progeny

从基因表达通路响应基因活动推理

Bioconductor版本:版本(3.16)

后代是资源利用公开的大纲要信号扰动实验产生共同的核心途径反应人类和小鼠的基因。这些,加上任何统计方法,可以用来推断通路从散装或单细胞转录组的活动。

作者:迈克尔·舒伯特(aut),阿尔贝托Valdeolivas(施)、基督教h .荷兰(施),伊戈尔Bulanov[所有],Aurelien Dugourd (cre,施莱)

维护人员:Aurelien Dugourd < Aurelien。在bioquant.uni-heidelberg.de dugourd >

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HTML	R脚本	后代通路签名
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	FunctionalPrediction,GeneExpression,GeneRegulation,软件,SystemsBiology
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证	Apache许可(= = 2.0)|文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	Biobase统计数据,dplyr,tidyr,ggplot2,ggrepel,gridExtra,解耦,reshape2
链接
建议	气道,biomaRt,BiocFileCache,扫帚,修拉,SingleCellExperiment,DESeq2,BiocStyle,knitr,readr,readxl,pheatmap,宠物猫,rmarkdown,testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/saezlab/progeny
BugReports	https://github.com/saezlab/progeny/issues
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包档案

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源包	progeny_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	progeny_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	progeny_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	progeny_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/progeny
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/后代
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/progeny/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/progeny/
包下载报告	下载数据