miRSM

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRSM

在异构数据推断microrna的海绵模块

Bioconductor版本:版本(3.16)

包旨在识别microrna的海绵在异构数据模块。它提供了一些函数来研究microrna的海绵模块,包括流行的方法推断基因模块(候选人microrna的海绵模块),和一个函数来识别microrna的海绵模块,以及一些功能进行模块化分析microrna的海绵模块。

作者:张Junpeng (aut (cre)

维护人员:张Junpeng < zhangjunpeng411 gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRSM”)

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HTML	R脚本	miRSM:推断microrna的海绵在异构数据模块
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细节

biocViews	BiomedicalInformatics,聚类,GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneTarget,微阵列,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	WGCNA,flashClust,dynamicTreeCut,联合会,igraph,linkcomm,制程,NMF,biclust,iBBiG,fabia。,BicARE,isa2,s4vd,BiBitR,rqubic,Biobase,PMA统计数据,dbscan,子空间,mclust,宽边帽,ppclust,miRspongeR,Rcpp跑龙套,SummarizedExperiment,GSEABase,org.Hs.eg.db,MatrixCorrelation,能源
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	miRSM_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	miRSM_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	miRSM_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	miRSM_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRSM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRSM
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miRSM/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miRSM/
包下载报告	下载数据