metabCombiner

DOI:10.18129 / B9.bioc.metabCombiner

LC-MS结合代谢组学特征测量方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包将LC-HRMS代谢组学数据集从相似但不一定相同的条件下分析的生物相似标本中获得。峰值选择和简单对齐的代谢组学特征表(包括m/z, rt和每个样本丰度测量，加上可选标识符和加加注释)被接受为输入。该包输出一个特征对对齐的组合表，组织成相似m/z的组，并根据相似度得分进行排名。假设输入表是使用类似(但不一定完全相同)的分析方法获得的。

作者:Hani Habra [aut, cre]，真主安拉Karnovsky [ths]

维护者:Hani Habra

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“metabCombiner”)

超文本标记语言	R脚本	结合LC-MS代谢组学数据集与metabCombiner
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)，dplyr(> = 1.0)
进口	方法,mgcv，脱字符号，S4Vectors，统计，utils，rlang、图形、matrixStats，tidyr
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://www.github.com/hhabra/metabCombiner/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	metabCombiner_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	metabCombiner_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	metabCombiner_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	metabCombiner_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabCombiner
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metabCombiner
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metabCombiner/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/metabCombiner/
软件包下载报告	下载数据