这是发展JASPAR2016版本;稳定发布版本请参见JASPAR2016.
Bioconductor版本:开发(3.17)
JASPAR 2016的数据包。要搜索这个数据库,请使用TFBSTools包(>= 1.8.1)。
作者:葛坦<葛格。网址:imperial.ac.uk>
维护者:葛谭<葛格。网址:imperial.ac.uk>
引用(来自R,输入引用(“JASPAR2016”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.3")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #下面初始化BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("JASPAR2016")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,GeneRegulation,MotifAnnotation |
版本 | 1.27.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 3.2.2),方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://jaspar.genereg.net/ |
这取决于我 | |
进口我 | ATACCoGAPS |
建议我 | CAGEWorkflow,chromVAR,TFBSTools |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | JASPAR2016_1.27.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/JASPAR2016 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/JASPAR2016 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/JASPAR2016/ |
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