这是发展寄居的版本;稳定发布版本请参见寄居.
Bioconductor版本:开发(3.16)
单分子跟踪已经发展成为基因组测序的一种新的补充方法,它报告被研究分子的实时生物物理特性以及与其编码序列相关的特性;在这里,我们提供了“旅居者”软件包,以解决与分析和理解高通量单分子跟踪数据相关的统计和生物信息需求。
作者:刘盛[aut],孙杰[aut],唐晓娜[aut], Young Soo Sung [aut], Carl Wu [aut], Anand Ranjan [ctb], Vu Nguyen [ctb], Sojourner Developer [cre]
维护者:Sojourner Developer
引用(从R中,输入引用(“寄居”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("sojourner")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“寄居”)
超文本标记语言 | R脚本 | Sojourner:单分子轨迹统计分析的R包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,技术,WorkflowStep |
版本 | 1.11.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | ggplot2,dplyr,reshape2,gridExtra,EBImage,质量,R.matlab,Rcpp,fitdistrplus,mclust,minpack.lm,mixtools,mltools,nls2,plyrsampSurf,尺度,闪亮的,shinyjs,sp,truncnorm,跑龙套,统计数据,象图,rlang、图形、grDevices、网格、编译器、晶格 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/sheng-liu/sojourner |
BugReports | https://github.com/sheng-liu/sojourner/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | sojourner_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | sojourner_1.11.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | sojourner_1.11.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sojourner |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/寄居 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/sojourner/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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