Sigpathway

doi：10.18129/b9.bioc.sigpathway

这是发展SigPathway的版本；对于稳定版本，请参阅Sigpathway。

途径分析

生物导体版本：开发（3.16）

通过计算NT_K和NE_K统计量来进行途径分析，如Tian等人所述。（2005）

作者：Weil Lai（优化的R和C代码），Lu Tian和Peter Park（算法开发和初始R代码）

维护者：weil lai

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ sigpathway”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Sigpathway”）

PDF	R脚本	Sigpathway
PDF		参考手册

细节

生物浏览	差异性，，，，多重组合，，，，软件
版本	1.65.0
在生物导体中	Bioc 1.9（R-2.4）（16年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 2.10）
进口
链接
建议	HGU133A.DB（> = 1.10.0），XML（> = 1.6-3），AnnotationDbi（> = 1.3.12）
系统要求
增强
URL	http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506577102http://www.chip.org/~ppark/supplements/pnas05.html
取决于我	翻译
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	sigpathway_1.65.0.tar.gz
Windows二进制	sigpathway_1.65.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	sigpathway_1.65.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigpathway
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/sigpathway
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/sigpathway/
软件包下载报告	下载统计