pathRender

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathRender

这是发展pathRender的版本;稳定版请参见pathRender

渲染分子路径

Bioconductor版本:开发(3.16)

从路径数据库构建图形,通过Rgraphviz渲染。

作者:李龙<李龙at isb- sibling .ch>

维护者:Vince Carey

引文(从R内,输入引用(“pathRender”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("pathRender")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“pathRender”)

PDF R脚本 pathRender概述
PDF R脚本 由表达图着色的路径图
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GraphAndNetwork通路软件可视化
版本 1.65.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(16年)
许可证 LGPL
取决于 RgraphvizRColorBrewer提出AnnotationDbi,方法,统计4
进口
链接
建议 所有hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL //www.andersvercelli.com
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 pathRender_1.65.0.tar.gz
Windows二进制 pathRender_1.65.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) pathRender_1.65.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathRender
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathRender
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pathRender/
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