affylmgui

doi:10.18129/b9.bioc.affylmgui

这是发展Affylmgui的版本;对于稳定版本,请参阅affylmgui

使用Affymetrix微阵列的Limma包装的GUI

生物导体版本:开发(3.16)

使用Affy和Limma软件包分析Affymetrix微阵列基因表达数据的图形用户界面(GUI)。

作者:James Wettenhall [CRE,AUT],Gordon Smyth [AUT],Ken Simpson [aut],Keith Satterley [CTB]

维护者:gordon smyth

引用(从r内,输入引用(“ affylmgui”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ affylmgui”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ affylmgui”)

html 大约.html
PDF R脚本 Affylmgui小插图
html custmenu.html
PDF 从affylmgui文件中提取affy和limma对象
html index.html
html WindowsFocus.html
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 批处理效应,,,,贝叶斯,,,,DataImport,,,,差异性,,,,GUI,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,专有Platratforms,,,,QualityControl,,,,回归,,,,软件,,,,时间科,,,,转录,,,,Mrnamicroarray
版本 1.71.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口 Grdevices,图形,统计,UTILS,TCLTK,TKRPLOT,,,,林玛,,,,副词,,,,affyio,,,,affyplm,,,,GCRMA,,,,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,生物管理器,,,,R2HTML,,,,Xtable
链接
建议
系统要求
增强
URL http://bioinf.wehi.edu.au/affylmgui/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Affylmgui_1.71.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉) Affylmgui_1.71.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmgui
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/affylmgui
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/affylmgui/
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