SubCellBarCode

DOI:10.18129 / B9.bioc.SubCellBarCode

这是发展SubCellBarCode版本;稳定的发布版本,请参阅SubCellBarCode。

SubCellBarCode:集成工作流健壮的映射和可视化整个人类空间蛋白质组

Bioconductor版本:发展(3.16)

质谱仪proteome-wide映射的基础空间蛋白质组学使蛋白质亚细胞定位(Orre et al . 2019,分子细胞)。SubCellBarCode R包强劲将蛋白质分为相应的亚细胞定位。

作者:棕褐色亚斯兰

亚斯兰维护者:棕褐色<棕褐色。亚斯兰在ki.se >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SubCellBarCode”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	SubCellBarCode R减价小插曲
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	Rtsne,scatterplot3d,脱字符号,e1071,ggplot2,gridExtra,networkD3,ggrepel、图表、数据、org.Hs.eg.db,AnnotationDbi
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SubCellBarCode_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	SubCellBarCode_1.13.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SubCellBarCode_1.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SubCellBarCode
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SubCellBarCode
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SubCellBarCode/
包下载报告	下载数据