Netsam

doi：10.18129/b9.bioc.netsam

这是发展NetSAM的版本；对于稳定版本，请参阅Netsam。

网络串行和模块化

生物导体版本：开发（3.16）

NetSAM（网络串行和模块化）软件包将加权或未加权网络作为输入，执行网络序列化和模块化分析，并生成可以用作一维网络可视化的输入的文件工具NETGESTALT（http://www.netgestalt.org）或其他网络分析。NetSAM软件包还可以基于输入矩阵数据生成相关网络（例如共表达网络），对相关网络执行序列化和模块化分析，并计算样本特征和模块之间的关联，或识别模块的关联GO术语。

作者：Jing Wang

维护者：gmail.com> jhiao shi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ netsam”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ NetSAM”）

PDF	R脚本	NetSAM用户指南
PDF		参考手册

细节

生物浏览	软件
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（8。5年）
执照	LGPL
要看	r（> = 3.0.0），串行（> = 1.0-6），Igraph（> = 0.6-1），工具（> = 3.0.0），WGCNA（> = 1.34.0），Biomart（> = 2.18.0）
进口	方法，AnnotationDbi（> = 1.28.0），多帕尔（> = 1.0.10），foreach（> = 1.4.0），生存（> = 2.37-7），go.db（> = 2.10.0），R2HTML（> = 2.2.0），DBI（> = 0.5-1）
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，org.sc.sgd.db，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.rn.eg.db，，，，org.dr.eg.db，，，，org.ce.eg.db，，，，org.cf.eg.db，，，，org.dm.eg.db，，，，org.at.tair.db，，，，rmarkDown，，，，尼特，，，，降价
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	netsam_1.37.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	netsam_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netsam
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/netsam
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/netsam/
软件包下载报告	下载统计