CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

这是发展CancerSubtypes版本;稳定版请参见CancerSubtypes．

基于多个基因组数据集的癌症亚型识别、验证和可视化

Bioconductor版本:开发(3.16)

CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型识别计算生物学方法，并提供了基于多组学数据(如基因表达、miRNA表达、DNA甲基化等)的癌症亚型分析的标准化框架。

作者:徐桃生[aut, cre]

维护者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CancerSubtypes")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CancerSubtypes”)

超文本标记语言	R脚本	CancerSubtypes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，软件，可视化
版本	1.23.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 4.0)，sigclust，NMF
进口	iCluster，集群，嫁祸于，limma，ConsensusClusterPlusgrDevices,生存
链接
建议	BiocGenerics，knitr，RTCGA.mRNA，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes
BugReports	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CancerSubtypes_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	CancerSubtypes_1.23.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CancerSubtypes_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerSubtypes
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CancerSubtypes/
软件包下载报告	下载数据