cbaf

DOI:10.18129 / B9.bioc.cbaf

自动功能比较来自cbioportal.org的各种omic数据

Bioconductor版本:发行版(3.15)

这个包包含的功能可以方便地分析和比较不同癌症/癌症亚组的组学数据。到目前为止，它是兼容RNA-seq, microRNA-seq，微阵列和甲基化数据集存储在cbioportal.org。

作者:Arman Shahrisa [aut, cre, cph]， Maryam Tahmasebi Birgani [aut]

维护者:Arman Shahrisa < Shahrisa。阿曼在hotmail.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cbaf")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“cbaf”)

超文本标记语言	R脚本	cbaf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AssayDomain，BiomedicalInformatics，ComparativeGenomics，DNAMethylation，表观遗传学，GeneExpression，遗传学，微阵列，ResearchField，软件，转录，转录组
版本	1.18.4
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	BiocFileCache，RColorBrewer，cBioPortalData，genefilter，gplots， grDevices, stats, utils，openxlsx
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	cbaf_1.18.4.tar.gz
Windows二进制	cbaf_1.18.4.zip
macOS二进制(x86_64)	cbaf_1.18.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cbaf
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cbaf/
包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档