SynMut

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynMut

SynMut:设计具有不同基因组特征的同义突变序列

Bioconductor版本:发行版(3.16)

设计具有特定二核苷酸或密码子组成的病毒突变体的要求越来越高。在设计突变体时，该工具可以同时考虑双核苷酸偏好和/或密码子使用偏向。这是一个强大的工具，在硅设计的DNA序列突变体。

作者:顾浩高[aut, cre]， Leo L.M. Poon [leading]

维护:Haogao Gu

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SynMut”)

超文本标记语言	R脚本	SynMut:为DNA序列设计同义突变体
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文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentalDesign，预处理，SequenceMatching，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	seqinr、方法、Biostrings，stringr，BiocGenerics
链接
建议	BiocManager，knitr，rmarkdown，testthat，devtools，prettydoc，胶水
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Koohoko/SynMut
BugReports	https://github.com/Koohoko/SynMut/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SynMut_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	SynMut_1.14.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SynMut_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SynMut_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynMut
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SynMut
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SynMut/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SynMut/
软件包下载报告	下载数据