光谱

doi：10.18129/b9.bioc.spectra

质谱数据的光谱基础架构

生物导体版本：版本（3.15）

光谱软件包定义了用于存储和处理质谱光谱和功能的有效基础架构，以子集，过程，可视化和比较光谱数据。它提供了不同的实现（后端）来存储质谱数据。这些包括为快速数据访问和处理和后端调整的后端，以确保非常小的记忆足迹。

作者：rformassspectrometry package维护器[cre]，laurent gatto [aut]，约翰内斯·雷纳[AUT]，塞巴斯蒂安·吉布[AUT]，Jan Stanstrup [CTB]

维护器：rformassspectrometry package naverer

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Spectra”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Spectra”）

html	R脚本	光谱对象的描述和使用
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基础设施，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，蛋白质组学，，，，软件
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（2年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.0.0），S4VECTORS，，，，生物比较，，，，蛋白质（> = 1.25.1）
进口	方法，iranges，，，，mscoreutils（> = 1.7.5），图形，grdevices，统计，工具，utils，FS，，，，生物基因
链接
建议	测试，，，，尼特（> = 1.1.0），MSDATA（> = 0.19.3），roxygen2，，，，生物使用（> = 2.5.19），MZR（> = 2.19.6），RHDF5（> = 2.32.0），rmarkDown，，，，VDIFFR（> = 1.0.0）
系统要求
增强
URL	https://github.com/rformassspectrometry/spectra
BugReports	https://github.com/rformassspectrometry/spectra/issues
取决于我	msbackendmassbank，，，，msbackendmgf，，，，msbackendmsp，，，，MSBACKENDRAWFILEREREDER
进口我	化合物，，，，代谢通道，，，，MobilityTransFormr
建议我	metnet，，，，psmatch，，，，XCMS
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Spectra_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	spectra_1.6.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Spectra_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spectra
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/光谱
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/spectra/
软件包下载报告	下载统计