SEtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools

SEtools:用于总结实验的工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这包括一组用于使用summarizeexperiment类的工具，包括合并、融化和聚合函数。这个包中的绘图函数已经被移到了sechm包中。

作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]

维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SEtools”)

超文本标记语言	R脚本	SEtools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，sechm
进口	BiocParallel，矩阵，DESeq2，S4Vectors，data.table，刨边机，openxlsx，pheatmap统计数据,circlize、方法、股东价值分析
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/plger/SEtools
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SEtools_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	SEtools_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SEtools_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SEtools_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEtools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEtools
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SEtools/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SEtools/
软件包下载报告	下载数据