RNAmodR。AlkAnilineSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.AlkAnilineSeq

AlkAnilineSeq检测m7G, m3C和D的修饰

Bioconductor版本:发行版(3.16)

RNAmodR。AlkAnilineSeq从AlkAnilineSeq协议生成的实验数据中检测RNA上的m7G, m3C和D修饰。该包构建在RNAmodR包的核心功能之上，用于检测高通量测序数据中修改的特定模式。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]，丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR.AlkAnilineSeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)

超文本标记语言	R脚本	RNAmodR。AlkAnilineSeq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序，软件，可视化，WorkflowStep
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口	方法,S4Vectors，IRanges，BiocGenerics，GenomicRanges，Gviz
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，rtracklayer，Biostrings，RNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq/issues
全靠我
进口我
建议我	RNAmodR。毫升
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RNAmodR.AlkAnilineSeq/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq/
软件包下载报告	下载数据