MetaVolcanoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaVolcanoR

基因表达元分析可视化工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

MetaVolcanoR结合差异基因表达结果。它采用三种策略来总结不同研究中的差异基因表达。i)随机效应模型(REM)方法，ii) p值组合方法，iii)投票计数方法。在所有情况下，MetaVolcano利用火山图推理可视化基因表达元分析结果。

作者:Cesar Prada [aut, cre]， Diogenes Lima [aut]， Helder Nakaya [aut, ths]

维护者:Cesar Prada < Cesar . Prada。Medina在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MetaVolcanoR”)

超文本标记语言	R脚本	MetaVolcanoR输入:差分表达式示例
超文本标记语言	R脚本	MetaVolcanoR:差异表达元分析工具
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细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，软件，转录组，mRNAMicroarray
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.1)
进口	方法,data.table，dplyr，tidyr，情节，ggplot2，cowplot平行,metafor，metap，rlang，topconfects， grDevices，图形，统计，htmlwidgets
链接
建议	knitr，减价，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MetaVolcanoR_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MetaVolcanoR_1.12.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	MetaVolcanoR_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MetaVolcanoR_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaVolcanoR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MetaVolcanoR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MetaVolcanoR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MetaVolcanoR/
软件包下载报告	下载数据