MSstatsSampleSize

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsSampleSize

高维基于ms的蛋白质组学实验优化设计的仿真工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包估计输入蛋白质丰度数据中的方差，并基于方差估计模拟具有预定义数量的生物重复的数据。它报告了分类器的平均预测精度和模拟多次迭代的平均蛋白质重要性。

作者:Ting Huang [aut, cre]， Meena Choi [aut]， Olga Vitek [aut]

维护人员:Ting Huang

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MSstatsSampleSize")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MSstatsSampleSize”)

超文本标记语言	R脚本	MSstatsSampleSize用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类，DifferentialExpression，ExperimentalDesign，MassSpectrometry，PrincipalComponent，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)
进口	ggplot2，BiocParallel，脱字符号，gridExtra，reshape2，统计，utils, grDevices，图形，MSstats
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ !论坛/ msstats
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSstatsSampleSize_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MSstatsSampleSize_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MSstatsSampleSize_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MSstatsSampleSize_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsSampleSize
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstatsSampleSize
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsSampleSize/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSstatsSampleSize/
软件包下载报告	下载数据